Líneas de Investigación:
– Mecanismo molecular de patogénesis en fusarium oxysporum
– Transducción de señales mediante proteínas kinasas
– Factores de transcripción de hongos filamentosos
– Enzimas lacasas
– Biogénesis de pared celular fúngica

Proyectos y convenios investigación y agroalimentación:

Título: Mecanismos genéticos de la infección fúngica inducidos por el hospedador
Participantes: Antonio Di Pietro (Co-IP), Mª Isabel González Roncero (Co-IP), Concha de la Hera, Carmen Ruiz Roldán
Referencia del proyecto: BIO2016-78923-R
Entidad Financiadora: Ministerio de Economía y Competitividad
Duración, desde: diciembre 2016 – diciembre 2019
Financiación recibida: 350.000 €

Título: Adaptación genómica y molecular al estilo de vida patogénico en Fusarium oxysporum: PATHOADAPT
Participantes: Antonio Di Pietro (Co-IP), Mª Isabel González Roncero (Co-IP), Concha de la Hera, Carmen Ruiz Roldán
Referencia del proyecto: BIO2013-47870-R
Entidad financiadora: MINECO
Duración: 01/01/2014-31/12/2016
Financiación recibida: 370.000 €

Título: Función de las moléculas señalizadoras NO y ROS en el establecimiento y la regulación de interacciones mutualistas y patogénicas en tomate
Participantes Antonio Di Pietro, María Romero Puertas, Mª José Pozo; Estación Experimental del Zaidín (CSIC), Granada
Referencia del proyecto: P12-BIO-296
Entidad financiadora: Junta de Andalucía, Proyecto de Excelencia
Duración: 01/01/2014-31/12/2017
Financiación recibida: 152.000 €

Título: Sensing and integration of signals governing cell polarity and tropism in fungi: FUNGIBRAIN.
Antonio Di Pietro (IP grupo español)
Referencia del proyecto: FP7-PEOPLE-ITN-607963
11 Grupos y empresas participantes.
Duración: 01/10/2013-30/09/2017
Financiación recibida: 476.865 €

Título: Procesos celulares relacionados con la patogénesis en Fusarium oxysporum
Participantes: Mª Isabel González Roncero, Antonio Di Pietro, Concha de la Hera, Carmen Ruiz Roldán
Referencia del proyecto: CVI-7319
Entidad financiadora: Junta de Andalucía, Proyecto de Excelencia
Duración: 01/03/2013-31/12/2016
Financiación recibida: 168.682 €

Título: Signaling circuitry controlling fungal virulence: identification and characterization of conserved and specific fungal virulence genes as common antifungal target.
Antonio Di Pietro (IP grupo español)
Referencia del proyecto: FP7-PEOPLE-ITN-237936
ARIADNE. 9 Grupos y empresas participantes
Duración: 01/01/2010-31/12/2013
Financiación recibida: 391.620 €

Título: Host-induced gene silencing by RNAi in fungal and oomycete pathogens for healthier and safer food: ds
Antonio Di Pietro (IP grupo español)
Referencia del proyecto: EUI2009-03942
7 grupos y empresas participantes: 7
Entidad financiadora: Plant KBBE 2009/MICINN
Duración: 01/03/2010-30/06/2013
Financiación recibida: 270.000 €

Publicaciones recientes:
– Navarro-Velasco GY, Di Pietro A, López-Berges MS (2023) Constitutive activation of TORC1 signalling attenuates virulence in the cross-kingdom fungal pathogen Fusarium oxysporum. Mol Plant Pathol 24:289-301;
– Fernandes TR, Mariscal M, Serrano A, Segorbe D, Fernández-Acero T, Martín H, Turrà D, Di Pietro A (2023) Cytosolic pH controls fungal MAPK signaling and pathogenicity. mBio 00:e00285-23.
– Mariscal M, Fernandes TR, Di Pietro A (2023) Role of pH in the control of fungal MAPK signalling and pathogenicity. Series: The Mycota, vol 5. Scott, B., Mesarich, C. (eds) Plant Relationships. Springer, Cham. ISBN 978-3-031-16503-0
– Mariscal M, Miguel-Rojas C, Hera C, Fernandes TR, Di Pietro A. (2022) Fusarium oxysporum casein kinase 1, a negative regulator of the plasma membrane H+-ATPase Pma1, is required for development and pathogenicity. J Fungi 8:1300.
– Palos-Fernández R, Turrà D, Di Pietro A. (2022) The Gal4-type transcription factor Pro1 integrates inputs from two different MAPK cascades to regulate development in the fungal pathogen Fusarium oxysporum. J Fungi 8:1242.
– Redkar A, Sabale M, Schudoma C, Zechmann B, Gupta YK, López-Berges MS, Venturini G, Gimenez-Ibanez S, Turrà D, Solano R, Di Pietro A. (2022) Conserved secreted effectors contribute to endophytic growth and multi-host plant compatibility in a vascular wilt fungus. The Plant Cell 34:3214-3232.
– Redkar A, Sabale M, Zuccaro A, Di Pietro A. (2022) Determinants of endophytic and pathogenic lifestyle in root colonizing fungi. Curr Opin Plant Biol 67:102226.
– Gámez-Arjona FM, Vitale S, Voxeur A, Dora S, Müller S, Sancho-Andrés G, Montesinos JC, Di Pietro A, Sánchez-Rodríguez C. (2022) Impairment of the cellulose degradation machinery enhances Fusarium oxysporum virulence but limits its reproductive fitness. Sci Adv 8:eabl9734.
– Hassing B, Candy A, Eaton CJ, Fernandes TR, Mesarich CH, Di Pietro A, Scott B. (2022) Localisation of phosphoinositides in the grass endophyte Epichloë festucae and genetic and functional analysis of key components of their biosynthetic pathway in E. festucae symbiosis and Fusarium oxysporum pathogenesis. Fungal Genet Biol 159:103669.
– Redkar A, Gimenez Ibanez S, Sabale M, Zechmann B, Solano R, Di Pietro A. (2022) Marchantia polymorpha model reveals conserved infection mechanisms in the vascular wilt fungal pathogen Fusarium oxysporum. New Phytol 234:227-241.
– Fernandes TR, Serrano A, Di Pietro A. (2022) In vivo monitoring of cytosolic pH using the ratiometric pH sensor pHluorin. Methods Mol Biol 2391:99-107.
– Díaz CL, Gómez-Gil L, Pérez-Nadales E, Velasco GN, Di Pietro A. (2022) Quantification and isolation of spontaneous colony growth variants. Methods Mol Biol 2391:55-62.

Master y Doctorado:

Master en Biotecnología
https://www.uco.es/estudios/idep/masteres/biotecnologia

El Máster en Biotecnología pretende ser una oferta de postgrado para los grados de Bioquímica, Biología, Medicina, Veterinaria, Ciencia y Tecnología de los Alimentos, Ciencias Ambientales, Química e Ingeniería Agroalimentaria que se imparten en la Universidad de Córdoba, así como para alumnos españoles o extranjeros de titulaciones afines procedentes de otras Universidades. Es importante resaltar, que el MB-UCO tiene una trayectoria de casi 10 años, y que obtuvo la verificación positiva por la Secretaría General del Consejo de Coordinación Universitaria, siendo el curso 2009/10 el de su implantación, ya adaptado al Plan Bolonia. Esta Titulación será también una vía para la formación de profesionales y doctores entre los egresados de dichos grados. El objetivo de este máster es doble. Por una parte se busca formar a los alumnos que pretendan dedicarse profesionalmente a la industria biotecnológica y/o actualizar los conocimientos y mejorar la formación de los profesionales y a dedicados a esta actividad. Por otra parte, y no excluyente de la anterior, se busca formar a los alumnos que pretendan incorporarse en centros científicos de investigación en Biotecnología y en los equipos de investigación de organismos públicos, privados y empresas.
Esta doble orientación profesional y académico/investigadora del Máster intenta responder al objetivo de ofrecer formación de calidad a los futuros profesionales de la Biotecnología. Los egresados del MB serán profesionales de gran valor para la empresa biotecnológica actual, y también para el conjunto de los territorios en los que estas empresas se asientan, ya que debido a su formación interdisciplinar universitaria, aportarán a la actividad empresarial los conocimientos y técnicas que hacen posible responder a las nuevas demandas sociales.
Los egresados del Máster pueden, asimismo, continuar sus estudios con la realización de una Tesis Doctoral dentro de un Programa de Postgrado.

Asignaturas impartidas
“Técnicas Básicas del DNA recombinante”
“Análisis e Interpretación de Genomas”
https://www.uco.es/eguiado/guias/2013-14/15699_2013-14.pdf
“Mecanismos de Patogénesis y de Resistencia a enfermedades en plantas”

Master en Producción, Protección y Mejora Vegetal
http://www.uco.es/estudios/idep/masteres/produccion-proteccion-mejora-vegetal
• El Máster en Producción, Protección y Mejora Vegetal (PPMV) tiene una orientación investigadora y un objetivo en formar a los estudiantes de grado de forma que les capacite para optar a un doctorado en el campo de la investigación agronómica, en especial en aspectos relacionados con las plantas cultivadas y todos los factores relacionados con su nutrición, manejo, mejora y protección. Se pretende conjugar una formación sólida en los contenidos propios del Máster con la flexibilidad que permita su capacitación en los campos y especialidades incluidos en el mismo.

Asignatura impartida
“Mecanismos de Patogénesis, y de Resistencia a enfermedades en plantas”

Doctorado en Biociencias y Ciencias Agroalimentarias
http://www.uco.es/estudios/idep/doctorado/programas/eida3/992011/biociencias-y-ciencias-agroalimentarias
• Se trata de un programa centrado en áreas agroalimentarias, muy relevantes del entorno económico y social de Andalucía y Córdoba. Se encuentra encuadrado en la Escuela Internacional de Doctorado del Campus de Excelencia en Agroalimentación (CeiA3), y en el que participan investigadores de trece departamentos de la Universidad de Córdoba y de Centros de calidad investigadora contrastada como el IFAPA y el Instituto de Agricultura Sostenible (IAS). Sus numerosas líneas de investigación se desarrollan en perfiles Biotecnológico, Agrícola, Alimentario y Veterinario

Equipos y técnicas instrumentales avanzadas de las que dispone el grupo:
Técnicas:

– Marcaje fluorescente y localización subcelular de microorganismos y proteínas
– Identificación y cuantificación de hongos patógenos en cultivos vegetales
– Interrupción dirigida de genes (Knock-out) en hongos filamentosos
– Análisis e interpretación de de genomas y genes
– Ensayos de virulencia con hongos fitopatógenos

Equipos:

– Microscopio de fluorescencia
– PCR- cuantitativa a tiempo real
– Liofilización
– Ultracentrifugación

Líneas Estratégicas:
1) Nuevas estrategias para la protección de los cultivos frente al ataque por hongos patógenos. Los hongos patógenos son la principal causa de pérdidas en la cosecha a nivel mundial. La aparición de resistencias crea una necesidad urgente para el desarrollo de nuevas estrategias de control mas efectivas y compatibles con el medio ambiente.

Dentro de esta línea, nuestro grupo está trabajando en dos vertientes:
– Identificación de nuevas dianas moleculares (componentes de señalización y de la biosíntesis de pared) para el desarrollo de nuevos principios activos de fungicidas
Proyecto Europeo FP7 Marie Curie Initial Training Network (FP7-PEOPLE-ITN-237936): Signaling circuitry controlling fungal virulence: identification and characterization of conserved and specific fungal virulence genes as common antifungal targets (Acronym: ARIADNE). Colaboración con 8 grupos de investigación Europeos y la multinacional Bayer CropScience SA, Lyon, Francia

– Utilización de la estrategia del RNAi (inhibición de genes esenciales del patógeno por pequeñas moléculas de RNA expresadas en la planta) para la protección de los cultivos frente al ataque de los patógenos fúngicos y oomicetos
Proyecto ERA-Net (EUI2009-03942), ERA-NET Plant KBBE 2009: Host-induced gene silencing by RNAi in fungal and oomycete pathogens for healthier and safer food (Acronym: dsRNAguard). Colaboración con 6 grupos de investigación Europeos y la multinacional Bayer CropScience, Mohnheim, Alemania

2) Es necesario reforzar en la UCO el área de la genómica y bioinformática, y sus aplicaciones biológicas. Dichas líneas tendrán un impacto cada vez mayor sobre la investigación en el campo de la agroalimentación.

Dentro de esta segunda línea, nuestro grupo ha iniciado colaboraciones estratégicas:
– Colaboración con en Broad Institute for Genome Information, MIT, Harvard (EEUU). Secuenciación y análisis bioinformático del genoma del patógeno Fusarium oxysporum
Publicación conjunta en la revista Nature:
Ma L-J, van der Does HC, Borkovich KA, Coleman JJ, Daboussi M-J, Di Pietro A, Dufresne M, Freitag M, Grabherr M, Henrissat B, Houterman PM, Kang S, Shim W-B, Woloshuk C, Xie X, Xu J-R, Antoniw J, Baker SE, Bluhm BH, Breakspear A, Brown DW, Butchko RAE, Chapman S, Coulson R, Coutinho PM, Danchin EGJ, Diener A, Gale LR, Gardiner DM, Goff S, Hammond-Kosack KE, Hilburn K, Hua-Van A, Jonkers W, Kazan K, Kodira CD, Koehrsen M, Kumar L, Lee Y-H, Li L, Manners JM, Miranda-Saavedra D, Mukherjee M, Park G, Park J, Park S-Y, Proctor RH, Regev A, Ruiz-Roldan MC, Sain D, Sakthikumar S, Sykes S, Schwartz DC, Turgeon BG, Wapinski I, Yoder O, Young S, Zeng Q, Zhou S, Galagan J, Cuomo CA, Kistler HC, Rep M (2010) Comparative genomics reveals mobile pathogenicity chromosomes in Fusarium oxysporum. Nature (in press)

– Recientemente se ha iniciado el análisis transcriptómico de F. oxysporum mediante microarrays Affymetrix, en colaboración con el Broad Institute, EEUU y el Functional Genomics Unit, Centro de Investigación Principe Felipe, Valencia, dentro del proyecto ERA-NET Pathogenomics BIO2008-04479-E.

Líneas temáticas:
– Biología Integrativa
– Mejora, Producción y Protección Vegetal